Bertolak dari visi ini, BMPTKKI memiliki misi memberikan pendampingan bagi percepatan dalam pemenuhan layanan standar nasional pendidikan demi pencapaian mutu pengajaran, penelitian dan pengabdian masyarakat semua.
PTKKI, memfasilitasi semua PTKKI untuk melakukan kerjasama nasional dan internasional dengan lembaga-lembaga gereja dan pendidikan keagamaan Kristen untuk mewujudkan penelitian, kelas dan kampus global.
Serta membantu gereja-gereja menyediakan sumber daya manusia gereja dan hasil-hasil kajian teologis yang relevan untuk memperkuat gereja dalam melaksanakan tugas dan panggilannya.
BMPTKKI yang telah berjalan selama lima tahun sejak berdirinya dalam Kongres Nasional I pada bulan Maret 2019.
Mengadakan Kongres Nasional II pada 8-9 Maret 2024 di Jakarta dengan agenda menerima dan mengesahkan anggota baru.
Laporan pertanggungjawaban Dewan Pengurus dan Dewan Pengawas, serta memilih Ketua Umum Dewan Pengurus dan Anggota Dewan Pengawas yang baru.
Kongres Nasional kedua ini diikuti oleh sekitar 250 utusan dari PTKK di seluruh Indonesia diawali dengan Ibadah Pembukaan yang menghadirkan Ketum PGI, Pdt. Gomar Gultom. (Red)
